PIC 関連資料

• PIC のプロトコール論文（STAR Protoc, 2022）PDF
  　PIC (Photo-Isolation Chemistry) の詳細プロトコールと、固定凍結切片や FFPE への応用も記載されています。
• PIC の初出論文（Nat Commun, 2021）PDF
  　PIC (Photo-Isolation Chemistry) の原理や開発経緯が詳しく記載されています。
• 空間トランスクリプトーム技術の概論（実験医学 2021年9月号）PDF
  　空間トランスクリプトーム技術に関する日本初の体系的レビューです。
• PIC の紹介（実験医学 2021年9月号）PDF
  　PIC の原理、活用例、特長などを紹介しています。
• PIC のプロトコール Excel
  　PIC のための組織の透過処理、in situ 逆転写、光照射、ライブラリ調製までを詳細に記載しています。
• 新鮮凍結切片の作り方（ドライアイス-イソペンタンの準備）Movie
  　新鮮凍結切片を作製するにあたり、ドライアイス-イソペンタンを準備します。
• 新鮮凍結切片の作り方（急速凍結のようす） Movie
  　新鮮凍結切片を作製するための急速凍結のようすです。

ChIP-Atlas 関連資料

• ChIP-Atlas のアップデート論文（Nucleic Acids Res, 2022）PDF
  　ChIP-Atlas に ATAC-seq と Bisulfite-seq を追加しました。
• ChIP-Atlas の初出論文（EMBO Rep, 2018）PDF
  　ChIP-seq 統合データベース、ChIP-Atlas のデータ処理方法や開発経緯が詳述されています。
• ChIP-Atlas の使い方（実験医学 2019年10月号）PDF
  　ChIP-Atlas の使い方が日本語で詳述されています。
• ChIP-Atlas の使われ方（JSBi Bioinform Rev, 2023）PDF
  　ChIP-Atlas の使われ方について、創薬、再生医学、遺伝性疾患研究における活用事例を中心に日本語で詳述されています。
• 環境汚染物質が健康被害をもたらす機序の解明に活用した論文（Epigenetics Chromatin, 2023）PDF
  　名大の山西芳裕 先生との共同研究で、環境中の汚染物質でクロマチン状態が変化するゲノム領域の上流因子を特定しました。
• 薬の作用機序の解明に活用した論文（BMC Bioinform, 2022）PDF
  　九工大（当時）の山西芳裕 先生との共同研究で、薬剤で発現変動する遺伝子の上流因子を特定しました。
• ChIP-Atlas に関する講演動画（2022年 日本分子生物学会年会）Movie
  　Bisulfite-seq と ATAC-seq データを統合した ChIP-Atlas 2.0 を日本語で紹介しています。